Lady Hastings délaissée par son mari parti découvrir le Nouveau Monde reçoit un jour de ses nouvelles lui annonçant qu'il a découvert le trésor de Guayanacapac.

Lady Vivian Hastings et Long John quittent Bristol pour rejoindre la cité de Guyanacapac en Amazonie. En effet, c'est dans cette contrée que Lord Hastings aurait caché l'or de la cité. Entre la belle Vivian et le pirate, les tensions sont nombreuses.

Le Neptune aborde les côtes d'Amérique du sud, au grand soulagement de tous. Un seul homme reste sans réactions : Moc "l'autochtone", qui réserve de terribles projets aux rescapés. Dans un premier temps l'équipage découvre le réconfort du lagon magique et espère trouver le trésor de Guyanacapac.

Long Silver, lady Vivian, le docteur Livesey et les derniers rescapés découvrent la cité de Guyanacapac.