Mello a enlevé le directeur de la préfecture de police japonaise et exige qu'on lui remette le death note en échange de sa libération. Mais lorsque le directeur meurt, Mello enlève la soeur de Light pour tenter encore une fois de récupérer le cahier. Une nouvelle lutte s'engage alors.

Light Yagami est un lycéen brillant, fils de policier. Un jour, il découvre un étrange carnet qui se révèle être le livre d'un dieu de la mort, Ryûk. Il apprend les terribles pouvoirs de ce carnet : tous ceux dont le nom est inscrit dans le death note meurent dans les 40 secondes qui suivent.

Un second kira, dont les méthodes sont celles de Light, a fait son apparition. Au quartier général d'enquête L contacte Light pour lui demander sa collaboration. Ce dernier découvre alors le sens caché du message envoyé par l'autre kira. Light décide alors d'organiser une rencontre.